平行院校志愿的投档原则是“分数优先，遵循志愿”。

省级招生主管部门分科类将考生按投档成绩从高分到低分排序并逐个投档，在依次检索考生所填A、B、C、D、E……志愿时，只要被检索的院校中一经出现符合投档条件的院校，即向该院校投档，该生即享受了该批次平行院校志愿投档机会，由高校决定其录取与否及所录取专业，并负责对退档考生的解释工作。

平行院校志愿投档时，省级招生主管部门根据有关高校提出的调档比例（一般不超过105%），按照上述投档原则进行投档。